Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copb2O55029 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb2O55029 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb2O55029 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb2O55029 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Copb2O55029 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Copb2O55029 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms