Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bnip3O55003 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bnip3O55003 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms