Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1baO35930 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gp1baO35930 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1baO35930 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms