Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Myh11O08638 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh11O08638 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh11O08638 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh11O08638 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh11O08638 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh11O08638 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh11O08638 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh11O08638 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms