Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8720K9J7F4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8720K9J7F4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8720K9J7F4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8720K9J7F4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms