Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vwa3bJ9JI28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms