Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10428J3QNV7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10428J3QNV7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10428J3QNV7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10428J3QNV7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10428J3QNV7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10428J3QNV7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10428J3QNV7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10428J3QNV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10428J3QNV7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms