Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200cJ3QK46 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms