Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pot1bH7BX60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pot1bH7BX60 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms