Protein–RNA interactions for Protein: G5E851

1700017D01Rik, MCG12892, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017D01RikG5E851 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700017D01RikG5E851 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700017D01RikG5E851 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700017D01RikG5E851 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700017D01RikG5E851 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700017D01RikG5E851 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700017D01RikG5E851 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
1700017D01RikG5E851 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700017D01RikG5E851 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700017D01RikG5E851 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700017D01RikG5E851 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
1700017D01RikG5E851 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms