Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Arfgef1G3X9K3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arfgef1G3X9K3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfgef1G3X9K3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms