Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmigd3G3X8R9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmigd3G3X8R9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmigd3G3X8R9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmigd3G3X8R9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms