Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h7bF8VPP8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h7bF8VPP8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h7bF8VPP8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms