Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh9F8VPK8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcdh9F8VPK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcdh9F8VPK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms