Protein–RNA interactions for Protein: E9QAJ8

Gm3468, Predicted gene 3468, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3468E9QAJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3468E9QAJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3468E9QAJ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3468E9QAJ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3468E9QAJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3468E9QAJ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3468E9QAJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3468E9QAJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3468E9QAJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3468E9QAJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3468E9QAJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms