Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh18E9Q9Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh18E9Q9Q6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms