Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TrdnE9Q9K5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TrdnE9Q9K5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms