Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r68E9Q0V3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms