Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chd2E9PZM4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Chd2E9PZM4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Chd2E9PZM4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Chd2E9PZM4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Chd2E9PZM4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Chd2E9PZM4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Chd2E9PZM4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chd2E9PZM4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd2E9PZM4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Chd2E9PZM4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd2E9PZM4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms