Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Soga1E1U8D0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Soga1E1U8D0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Soga1E1U8D0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms