Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9330159F19RikD3Z623 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9330159F19RikD3Z623 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9330159F19RikD3Z623 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9330159F19RikD3Z623 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
9330159F19RikD3Z623 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms