Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3N4

Hnrnph3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnph3D3Z3N4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnrnph3D3Z3N4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hnrnph3D3Z3N4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hnrnph3D3Z3N4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnph3D3Z3N4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnph3D3Z3N4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hnrnph3D3Z3N4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms