Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms