Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud4B2RRE7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otud4B2RRE7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms