Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf3B2KF05 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brpf3B2KF05 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf3B2KF05 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf3B2KF05 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms