Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn7aB1AYL1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Scn7aB1AYL1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms