Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Nfx1B1AY10 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nfx1B1AY10 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms