Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trabd2bB1ATG9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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