Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prr29B1ARI9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prr29B1ARI9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prr29B1ARI9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prr29B1ARI9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prr29B1ARI9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prr29B1ARI9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prr29B1ARI9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prr29B1ARI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prr29B1ARI9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms