Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox1B1APN4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhox1B1APN4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms