Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem238A9JSM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem238A9JSM3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms