Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prss40A6H6T1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prss40A6H6T1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prss40A6H6T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms