Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Herc3A6H6S0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Herc3A6H6S0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc3A6H6S0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms