Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatsperbA2RTF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CatsperbA2RTF1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms