Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Svep1A2AVA0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.2 ms