Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Upf2A2AT37 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf2A2AT37 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms