Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtcflA2APF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms