Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syndig1A2ANU3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1A2ANU3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms