Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd60A2AMD2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd60A2AMD2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms