Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm884A2A9H6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm884A2A9H6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms