Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdr2lA2A6T1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms