Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc27A2A6Q5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdc27A2A6Q5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdc27A2A6Q5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdc27A2A6Q5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms