Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms