Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc166S4R181 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc166S4R181 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc166S4R181 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms