Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc45Q9Z1X9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc45Q9Z1X9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc45Q9Z1X9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms