Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h3Q9Z0Y9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms