Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Nup160Q9Z0W3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Nup160Q9Z0W3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Nup160Q9Z0W3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Nup160Q9Z0W3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.63■■■■□ 3.14
Nup160Q9Z0W3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms