Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrknQ9WVS6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrknQ9WVS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrknQ9WVS6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms