Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bgrQ9WUZ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bgrQ9WUZ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3bgrQ9WUZ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.1 ms