Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc2Q9WUK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc2Q9WUK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.1 ms